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實時熒光定量PCR-咸陽PCR-南京英瀚斯生物科技(查看)

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2022-1-12  
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江蘇省南京市棲霞區和燕路371號東南大學國家大學科技園科創樓A301
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rna提取處理的步驟如下:

在玻璃燒杯中注入去離子水,加入depc使其終濃度為0.05%~0.1%depc-h2o。depc二焦---為活性很強的物,須在通風櫥中小心使用

將待處理的塑料制品放入一個可以高溫滅菌的容器中,注入depc-h2o,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中,在通風柜中37℃ 或室溫下處理過夜。

將depc-h2o小心倒入廢液瓶中,將裝有depc- h2o 處理過的塑料制品的容器以鋁箔封口,高溫高壓蒸汽滅菌至少30分鐘。

滅菌塑料制品烘烤干燥,置潔凈處備用。

玻璃和金屬物品250 ℃烘烤3小時以上。



rna提取及注意事項



研究基因的表達和調控時,需要從組織或細胞中分離純化rna。rna的高低經常影響rt-pcr、cdna庫構建和northern blot等分子生物學實驗的成敗。

主要試劑

trizol是一種新型總rna抽提試劑,pcr檢測,內含異---胍等物質,能迅速破碎細胞,抑制細胞釋放出的---酶。

1.

trizol試劑含有,具有毒性和---性,注重操作。

2.

rnase污染的主要來源是操作過程中手和空氣中的浮沉,咸陽pcr,注重配帶手套,樣品盡可能蓋嚴。

3. 細胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全會降低后得率,因為一部分rna會殘留在未裂解的細胞中。細胞裂解之后要看不見顆粒狀物質結締組織和骨除外。在清洗和裂解細胞時在低溫下操作,防止在操作過程中釋放的內源rnase降解了rna。

4. 酵母和一些---由于細胞壁的---結構,可以加入trizol試劑同時加入無rnase的玻璃珠并劇烈振蕩,使細胞裂解充分。

2-8℃ 避光保存一年。






dna測序檢測

1. pcr測序反應

(1)取0.2ml的pcr管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,按下表加試劑:

所加試劑測定模板管標準對照管

bigdye mix

1μl

1μl

待測的質粒dna

1μ 1

pgem-3zf (+)雙鏈dna

-1μ1

待測dna的正向引物

1μ 1

m13(-21)引物- 1μ 1

滅菌去離子水

2μ 1

2μ 1

總反應體積5μ 1,不加輕礦物油或石蠟油,蓋緊pcr管,用手指彈管混勻,fish檢測,稍離心。

(2)將pcr管置于9600或2400型pcr儀.上進行擴增。98c變性2min后進行pcr循環,

pcr循環參數為96c 10s, 50c 5s, 60°c4min, 25 個循環,擴增結束后設置4c保溫。

2.---法純化pcr產物

(1) 將混合物離心,將擴增產物轉移到1.5ml ep管中。

(2)加入25μ 1/---混合液,充分振蕩,置冰上10min以沉淀dna。12 000r/min于

4c離心30 min,實時熒光定量pcr,小心棄上清。

(3)加70%(v/v)的---50μ 1 洗滌沉淀2次。12 000r/min 于4c離心5min,小心棄上清和

管壁的液珠,真空干燥沉淀10~ 15min。

3.電泳前測序pcr產物的處理。

(1)加入12μ 1的tsr于離心管中,劇烈振蕩,讓其充分溶解dna沉淀,稍離心。

(2)將溶液轉移至蓋體分離的0.2ml pcr管中,稍離心。

(3)在pcr儀上進行熱變性(95c 2min),冰中驟冷,待_上機。

4..上機操作按儀器操作說明書安裝毛細管,進行毛細管位置的校正,人工手動灌膠和建立

運行的測序順序文件。

5.儀器將自動進行序列分析,并可根據用戶要求進行序列比較。如測序序列已知,可通過

序列比較以星號標出差異堿基處,提高工作效率。

6.測序完畢按儀器操作規程進行儀器清洗與保養。





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