穴盤的顏色也影響著植株根部的溫度。一般冬春季選擇黑色穴盤，因為可以吸收更多的太陽能，使根部溫度增加。而夏季或初秋，就要改為銀灰色的穴盤，以反射較多的光線，避免根部溫度過高。而白色穴盤一般透光率較高，育苗盤用法，會影響根系生長，所以很少選擇白色穴盤。當然白色的泡沫穴盤可以例外。
經過清洗并消毒的穴盤，亦可以重復使用，使用較為安全的季銨鹽類消毒劑，也可以用于灌溉系統的殺菌除藻，21孔育苗盤，避免其中-和青苔滋生。不建議用漂或進行消毒，因為氯會同穴盤中的塑料發生化學反應產生有毒的物質。
育苗盤節省種子用量，降低生產成本。出苗整齊，保持植物種苗生長的一致性，能與各種手動及自動播種機配套使用，便于集中管理，提高工作效率。移栽時不損傷根系，緩苗迅速，成活率高。苗木長大后，就應開始使用控根快速育苗技術，移入控根快速育苗容器內，育苗盤，繼續生長
在種苗生產過程中的工作是水分管理。但是在實際工作過程中卻常常由經驗不多的人來做。在不恰當的時間或者用錯誤的方式澆水，會-影響穴盤苗的生產。
不允許穴盤苗完全干燥；反之，基質中水分過于飽和也不行，會造成根系缺氧0-2%
穴盤苗生產水分管理一般以子葉展開為分界線。
防止育苗盤內水分散失。在覆蓋地膜時，需在育苗盤上安放一些小竹條，使薄膜與育苗盤之間留有空隙而不粘結。也可在基質裝盤后播種前將盤浸放到水槽中，水從穴盤底部慢慢往上滲，吸水較均勻，然后再放入苗床內。
節能省工省力。穴盤育苗采用精量播種，一次成苗，種子育苗盤，從基質混拌、裝盤、播種、覆蓋等一系 列作業實現了自動控制，苗齡比常規苗縮短10—20天，節省能源2／3，勞動效率提高了5—7倍。
育苗基質具有比重輕、保水能力強、根坨不易散等特點，緩苗快，成活率高。穴盤育苗還可配備機械化移栽。
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