染色質免l疫共沉淀技術(chip)
基于體內分析而發展的染色質免l疫沉淀分析chr omat in immunoprecipitat ionassay kit， chip)技術可以真實、完整地反映結合在dna序列上的調控蛋白。由于chip采用甲醛固定活l細胞或者組織的方法，因此能比較真實的反映細胞內tf與promoter的結合情況，還可以用來研究組蛋白的各種共價修飾與基因表達的關系。近年來，這種技術得到不斷的發展和完善。采用結合微陣列技術在染色體基因表達調控區域檢查染色體活性，是深入分析癌l癥、心血l管病以及中央神經系統紊亂等---主要通路的一-種非常有效的工具。
染色質免l疫沉淀分析(chip) 的基本原理是在活l細胞狀態下，當用甲醛處理時，相互靠近的蛋白與蛋白、蛋白與---(dna或rna)之間會產生共價鍵。細胞內，當f與promoter相互結合時，它們必然靠的比較近或者契合在一起，這個時候用甲醛處理，能使它們之間產生共價鍵。固定的蛋白質dna復合物通過超聲或酶處理將其隨機切斷為-定長度范圍內的染色質小片段然后通過抗原抗l體的特---識別反應沉淀此復合體，特---地富集目的蛋白結合的dnal片段，通過對目的片斷的純化與檢測，從而獲得蛋白質與dna相互作用的信息。通過qpcr或二代測序，篩選與目的蛋白互作的未知dna信息。
elisa 是一種結合抗原、抗ti特---反應和酶對底物高xiao催化作用的高敏感性免yi學實驗技術。elisa 的基礎是抗原或抗ti的固相化及抗原或抗ti的酶標記。結合在固相載體表面的抗原或抗ti仍保持其免yi學活性，酶標記的抗原或抗ti既保留其免yi學活性，---，又保留酶的活性。在測定時，受檢標本(測定其中的抗ti或抗原)與固相載體表面的抗原或抗ti起反應，fish檢測，洗滌使固相載體上形成的抗原抗ti復合物與液體中的其他物質分開，再加入酶標記的抗原或抗ti，通過反應使其結合在固相載體上。此時固相上的酶含量與標本中受檢物質的量呈一定的比例。加入酶反應的底物，底物被酶催化成為有色產物，產物的量與標本中受檢物質的量直接相關，故可根據呈色的深淺進行定性或定量分析。
外顯子測序
外顯子組測序exome-seq是對定向富集的基因組dna進行高通量測序，它能夠以相對低的費用對人類外顯子組進行拷問。2009年，外顯子組捕獲工具的出現，讓外顯子組測序這種技術迅速紅起來。到目前為止，已有超過1萬個外顯子組被測序。
如今有多家公司推出了外顯子組捕獲試劑，內蒙古pcr，包括羅氏nimblegen、安捷倫、illumina，還有現在的華大基因。這些方法究竟孰優孰劣，斯坦福大學醫學院遺傳學系的研究人員對市場上三個主流的外顯子組測序平臺進行了比較。該研究結果發表在《nature biotechnology》上。研究人員利用安捷倫、illumina和nimblegen的外顯子組測序平臺對同一個人類---樣品進行分析。他們的結 果表明，實時熒光定量pcr，nimblegen平臺作為一個使用高密度重疊探針的平臺，盡管覆蓋了較少的基因組區域，但在靈敏檢測小的變異時所需的測序量也少。在同樣獲得80m測序數據的情況下，nimblegen有97%的目標序列達到10x以上的測序---，而其他產品只有90%。而安捷倫和illumina的探針能夠在低密度下捕獲更多數量的變異。此外，illumina還捕獲了未翻譯的區域，這是nimblegen和安捷倫平臺無法靶定的。研究人員還比較了同一樣品的外顯子組測序和全基因組測序wgs，顯示外顯子組測序能夠檢測到wgs錯過的小變異。
除了文中提到了三個主流平臺，外顯子組捕獲方面的新產品也在不斷推出，研究人員的選擇也將更廣泛。羅氏nimblegen即將推出新一代的外顯子液相捕獲產品。這一新產品將可捕獲64m的基因組序列，包括外顯子以及mirna，它含與其他nimblegen液相捕獲產品相同的2.1m高密度探針，以高xiao、均一、特異、的定向捕獲。
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