蛋白質互作驗證服務
在后基因組時代,基因的表達產物蛋白質作為生物功能直接的執行者和體現者,-,在生物集體的生理及病理中扮演著重要的角色。高通量的蛋白質組學研究技術可以在上述過程中篩選出具有潛在價值的生物標記和靶點。但是長期以來,-的蛋白質表達分析譜并沒有提升我們對生物標志物的認識,其主要原因是差異蛋白的分析結果缺乏規模化的驗證。
動物組織細胞基因組dna提取
操作步驟
1. 取新鮮或冰凍動物組織塊0.1g0.5cm3,盡量剪碎。置于玻璃勻漿器中,加入1ml的細胞裂解緩沖液勻漿至不見組織塊,轉入1.5ml 離心管中,加入蛋白酶k
500ug/ml20μl,混勻。在65℃恒溫水浴鍋中水浴30min,海南pcr,也可轉入37℃水浴12~24h,間歇振蕩離心管數次。于臺式離心機以12000 rpm離心5min,取上清液入另
一離心管中。
2.加2倍體積異,倒轉混勻后,可以看見絲狀物,用100ul 吸頭挑出,涼干,用200ul te 重新溶解。可進行pcr反應等,需要進一步純化的按下列步驟進行
3.加等量的酚??振蕩混勻,離心12000 rpm,5min。
4.取上層溶液至另一管,加入等體積的?,振蕩混勻,離心12000 rpm,5min。
5. 取上層溶液至另一管,pcr實驗室,加入1/2體積的7.5mol/l氨加入2倍體積的無水---,混勻后室溫沉淀2min ,離心12000 rpm ,10min。
6.小心倒掉上清液,將離心管倒置于吸水紙上,將附于管壁的殘余液滴除掉。
7.用1ml 70%---洗滌沉淀物1次,離心12000 rpm , 5min。
8.小心倒掉上清液,將離心管倒置于吸水紙上,將附于管壁的殘余液滴除掉,室溫干燥。
9.加200ul te重新溶解沉淀物,然后置于4℃或?c20℃保存備用。
10.吸取適量樣品于genequant上檢測濃度和純度。
基因組甲l基化水平(methyl ati on content)的分析:
1.高l效液相色譜(hi gh-performanceli qui dchromatography,---多少錢, hplc)hplc是- -種比較傳統的方法,是根據dna或蛋白分子量和構象的不同而使其加以分離。由于在動態相和靜態相下分子的光吸收度并不相同而加以定量。隨著系統的壓強的增加,其分辨率增l高。故而能夠定量測定基因組整體水平dna甲l基化水平。該方法由ruo等1980年首l次---。過程是將dna樣品先經---或氫l氟酸水解成堿基,水解產物通過色譜柱,結果與標準品比較,用紫外光測定吸收峰值及其量,計算5 mc/(5mc+5c)的積分面積就得到基因組整體的甲l基化水平。這是一種檢測dna甲l基化水平的標準方法。
2.高l效毛細管電泳法(hi gh-per formance capillary electrophoresis, hpce)這是一-種利用窄孔熔融石英毛細管來從復合物中分離不同化學組分的技術。其基礎是在強電場下不同分子的由于其所帶電荷,大小,結構以及疏水性等不同而相互分開。用hipce方法處理dna水解產物來確定5mc水平,簡便,經濟且敏感性高。