分子實驗介紹——熒光定量pcr檢測
熒光定量pcr是檢測生物樣品中rna含量的普遍的方法,通過熒光染料或熒光標記的特---的探針,對pcr產物進行標記---,實時在線監控反應過程,---怎么做,結合相應的軟件可以對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。目前主要使用sybr green和taqman法對rna含量進行檢測。sybr green在低樣本量時成本較低,目前選用的較多。
sybr green i是一種只與dna雙鏈結合的熒光染料。當它與dna雙鏈結合時,發出熒光;從dna雙鏈上釋放出來時,熒光信號急劇減弱。因此,---多少錢,在一個體系內,其信號強度代表了雙鏈dna分子的數量。sybr green熒光染料-量pcr的基本過程是:1、開始反應,當sybr green染料與dna雙鏈結合時發出熒光。2、dna變性時,sybr green染料釋放出來,廣安pcr,熒光急劇減少。3、在聚合延伸過程中,引物退火并形成pcr產物。4、聚合完成后,sybr green染料與雙鏈產物結合,定量pcr系統檢測到熒光的凈增量加大。
實驗流程:細胞或組織rna提取-rna濃度檢測-rna逆轉錄-定量pcr檢測。
結果示例:
圖 a 基因擴增曲線圖;b 基因擴增溶解曲線圖;c mrna相對表達量變化
從圖中可以擴增曲線可以看出目的rna擴增效果,溶解曲線可以看出引物識別特---情況,通過使用δδct方法計算可以得到每個組中目的mrna表達變化。
蛋白質質譜鑒定服務
蛋白質protein是有機大分子,是構成細胞的基本有機物和生命活動的主要承擔者。蛋白質在催化生命體內各種反應進行、---、抵御外來物質入l侵及控制遺傳信息等方面都起著重要的作用。蛋白質的一級結構是---酸序列,通過鑒定---酸序列來匹配它的蛋白質,這是定性研究,是蛋白質組學的基礎,也是蛋白質組學的重要技術之一。
質譜一般由離子源、分析器mass ---yzer和離子檢測器detector三部分組成。傳統的質譜僅用于小分子揮發物質的分析,但隨著新的離子化技術的出現,如基質輔助激光解析電離飛行時間質譜(maldi-tof)和電噴霧電離質譜(esi-ms)等,質譜技術的出現為蛋白質分析提供了一種新的途徑。現在蛋白質組學基本研究手段是:以生物質譜技術為-,對蛋白質進行-、高通量分離、鑒定和分析。
蛋白質質譜鑒定的基本原理是用蛋白酶將蛋白質---成肽段混合物,經maildi或esi等軟電離手段將其離子化,然后通過分析器將具有特定質核比的肽段離子分離開來。通過實際譜圖和理論上蛋白質經過蛋白酶---后產生的一級質譜峰圖和二級質譜峰圖進行的比對,進行蛋白鑒定。
rip
技術概述
rip是研究體內蛋白與rna互作的重要技術。該技術先用甲醛等試劑交聯細胞內的“蛋白-rna”互作復合物,裂解細胞后,用靶蛋白特異的抗l體(或標簽抗l體)做免l疫沉淀,獲得“靶蛋白-rna”互作復合物,去交聯分離其中的rna;針對預測的靶蛋白結合rna的序列設計引物,-,
做qpcr實驗,驗證預測的rna是否與靶蛋白有結合,或者將分離出來的rna做高通量測序,篩選到可能與靶蛋白結合的rna。
技術流程
細胞交聯-***細胞裂解-***免l疫共沉淀***去交聯***rna分離***建庫***高通量測序(或qpcr)。