物流運輸不是一個孤立的環節，在組織運輸時， 要對運輸活動及涉及到的其他環節要科學規劃，統籌安排，盡量壓縮不-的環節，減少個別環節所占用成本。對有條件直運的，應盡可能采取直達運輸，減少二次運輸。同時，更要消除對流及隱含運輸、迂回運輸、重復運輸、過遠運輸等不合理現象。
合理選擇運輸工具。在目前多種運輸工具并存的情況下，必須注意根據不同貨物的特點及對物流時效的要求，對運輸工具所具有的特征進行綜合評價，以便作出合理選擇運輸工具的策略，并盡可能選擇廉價運輸工具。
危險貨物、鮮活貨物運輸
具有燃燒、腐蝕、線等性質，在運輸過程中容易引起人身傷害和財產毀損而需要特殊防護的物品稱為危險貨物。危險貨物的品名、包裝、標志、運輸-、托運手續、裝卸車要求，超限設備護送，在《鐵路危險貨物運輸規則》中均有具體規定。
鮮活貨物包括易腐貨物(如肉、魚、蛋、水果、蔬菜、鮮活植物等)和活動物(如禽、畜、獸、蜂、活魚、魚苗)兩大類。
易腐貨物，按其熱狀態又有貨物、冷卻貨物和未冷卻貨物之分。易腐貨物與非易腐不得按一批運輸，不同熱狀態的易腐貨物不得按一批運輸。
采用集裝箱為容器，使用汽車運輸的，為集裝箱運輸。又有以下分類方法：
國際集裝箱運輸和國內集裝箱運輸。標準集裝箱運輸和非標準集裝箱運輸。
普通集裝箱運輸和特種集裝箱運輸(危險、冷藏保溫和罐式集裝箱運輸等)。
整箱運輸和拼箱運輸。
用托運人的集裝箱進行的運輸和用承運人的集裝箱進行的運輸。
用單車型式車輛進行的集裝箱運輸和用牽引車加掛半掛車的列車組合形式進行的集裝箱運輸。
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