southern雜交
實(shí)驗(yàn)原理
southern印跡雜交southern blot是1975年由英-southern創(chuàng)建,是研究dna圖譜的基本技術(shù)。southern印跡雜交是進(jìn)行基因組dna特定序列定位的通用方法。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經(jīng)-性內(nèi)切酶-的dnal片段,將膠上的dna變性并在原位將單鏈dnal片段轉(zhuǎn)移至尼龍膜或其他固相支持物上,經(jīng)干烤或者紫外線照射固定,再與相對(duì)應(yīng)結(jié)構(gòu)的標(biāo)記探針進(jìn)行雜交,用放l射自顯影或酶反應(yīng)顯色,從而檢測(cè)特定dna分子的含量。
單核苷酸多態(tài)性( snp )實(shí)驗(yàn)
snp (single nucleotide polymorphisn即單核苷酸多態(tài)性 ,是由于單個(gè)核苷酸改變而導(dǎo)
實(shí)驗(yàn)方法原理:
snp (single nucleotide polymorphisn即單核苷酸多態(tài)性,是由于單個(gè)核苷酸改變而導(dǎo)
mirna測(cè)序
microrna(mirna)是一種大小約21—23個(gè)堿基的單鏈小分子rna,是由具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個(gè)堿基大小的單鏈rna前體經(jīng)過(guò)dicer酶加工后生成,不同于sirna雙鏈但是和sirna密切相關(guān)。microrna通過(guò)和靶基因mrna堿基配對(duì)引導(dǎo)沉默復(fù)合體risc降解mrna或抑制mrna的翻譯,從而在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控蛋白表達(dá)新發(fā)現(xiàn)mirna也能在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá)。mirna在物種進(jìn)化中相當(dāng)保守,在動(dòng)物、植物和-等中發(fā)現(xiàn)的mirna表達(dá)均有嚴(yán)格的組織特-和時(shí)序性。mirna在細(xì)胞生長(zhǎng)和發(fā)育過(guò)程中起多種作用,包括調(diào)控發(fā)育、分化、凋亡和增殖等。
目前研究mirna的方法主要是realtime-pcr、生物芯片技術(shù)以及第二代測(cè)序技術(shù)。基于第二代測(cè)序技術(shù)的mirna測(cè)序,可以一次獲得數(shù)百萬(wàn)條mirna序列,能夠快速鑒定出不同組織、不同發(fā)育階段、不同-狀態(tài)下已知和未知的mirna及其表達(dá)差異,為研究mirna對(duì)細(xì)胞進(jìn)程的作用及其生物學(xué)影響提供了有力工具。