目前，微波萃取的方式主要有常壓萃取、高壓萃取、靜態萃取、流動動態萃取等。常壓萃取的得率相對低，而高壓萃取存在安全問題；靜態萃取后的樣品，尚需進行后期處理，才能進入分析階段，不易分離純化，流動萃取是目前較好的微波萃取方式。為了進一步提高微波萃取的安全性及檢測速度，自主研發微波合成反應器，可以通過添加特殊物質或與其它方法結合應用，進一步提高它的萃取效果，---安全性能。例如，上海新拓微波溶樣測試技術有限公司生產的cw-2000型超聲-微波協同萃取/反應系統，就是將微波與超聲波結合起來，充分利用了超聲波的空化作用和微波的高能作用。此外，還可將微波萃取與現代分析測定方法結合，形成萃取測定分析連續進行，大力開發在線萃取分析結合應用的方式，從而簡化試樣的分析程序。
1.微波萃取時間與被測物樣品量、溶劑體積和加熱功率有關 。一般情況下，萃取時間在10～15 min內 。在萃取過程中，一般加熱1～2 min 即可達到所要求的萃取溫度 。有研究結果顯示，萃取率隨萃取時間延長而有所提高，但提高幅度不大，可忽略不計。
2.溶液的ph也會對微波萃取率產生一定的影響 。針對不同樣品，溶液有一個的用于萃取的酸堿度。從土壤中萃取除草劑三---時分別用naoh、nh3-nh4cl、hac、naac和hcl調節溶劑ph值，發現當溶劑的ph值介于4.7～9.8時，除草劑三---的回收率。
萃取溶劑 、萃取功率和萃取時間等是影響微波萃取效率的主要工藝參數 。萃取溶劑的選擇對萃取結果的影響---。微波萃取中首先要求溶劑必須有一定的極性，以吸收微波能進行內部加熱；其次，所選溶劑對目標萃取物必須具有較強的溶解能力； 此外，還需考慮溶劑的沸點及其對后續測定的干擾。溶劑的極性對于萃取率影響很大。
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