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具有較高的柱效，柱容量較低。分離復雜樣品較好,柱效稍低于0.25mm的色譜柱，但柱容量約高60%,具有類似于填充柱的柱容量，可用于分流進樣，也可用于不分流進樣，當柱容量是主要考慮因素時,如痕量分析，選擇大口徑毛細管柱較為合適。
不同的固定相對不同的分析物的影響不同，根據相似相溶原理，性質越相近，固定相對其的流動阻力越大，其保留時間越長。色譜柱就是通過這個原理將不同性質的混合物相互分開的。您現在就可以看到其實氣相色譜柱的分離效果主要取決于其固定相，柱長度，柱內徑，液膜厚度這幾個因素，從原理上講，這幾個因素相同的柱子，其分離效果是完全一樣的。
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